MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 9838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	CTTT	2	8	1520	1527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011026	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011026	A	6	6	1563	1568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011026	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011026	AATG	2	8	3040	3047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011026	CA	3	6	3058	3063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011026	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011026	CAAA	2	8	3120	3127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011026	TAA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011026	ATA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011026	ATT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011026	ATTGA	2	10	4245	4254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011026	TAA	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011026	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011026	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011026	CGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011026	AGA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011026	GAT	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011026	T	6	6	4523	4528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011026	TACC	2	8	7111	7118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011026	T	8	8	7148	7155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011026	A	7	7	10770	10776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011026	TGACT	2	10	10799	10808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011026	AAC	2	6	10840	10845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011026	CATC	2	8	10913	10920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011026	TTC	2	6	10939	10944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011026	GTT	2	6	10972	10977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011026	A	7	7	10992	10998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011026	CAT	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011026	ACA	2	6	11059	11064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011026	ATT	2	6	11071	11076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011026	T	6	6	11075	11080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011026	CCTG	2	8	13707	13714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011026	A	7	7	13730	13736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011026	T	7	7	13738	13744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011026	TTG	2	6	13758	13763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011026	T	6	6	13867	13872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011026	CAG	2	6	14723	14728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011026	TTCA	2	8	14729	14736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011026	ATT	2	6	14755	14760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011026	T	6	6	14759	14764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011026	T	7	7	15798	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011026	GCC	2	6	17011	17016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011026	A	6	6	17532	17537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011026	T	6	6	18829	18834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011026	GCA	2	6	19725	19730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011026	A	6	6	19748	19753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011026	AAT	2	6	19837	19842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011026	T	7	7	19842	19848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011026	A	7	7	19861	19867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011026	CA	3	6	19880	19885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011026	CAA	2	6	19950	19955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011026	ATG	2	6	19984	19989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011026	GTTC	2	8	20022	20029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011026	GAA	2	6	20030	20035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011026	TCA	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011026	TAAC	2	8	20047	20054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011026	AAC	2	6	20076	20081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011026	CAA	2	6	20090	20095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011026	AAC	2	6	20132	20137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011026	A	6	6	20202	20207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011026	A	6	6	20223	20228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011026	T	7	7	20232	20238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011026	AAG	2	6	22680	22685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011026	CGG	3	9	25418	25426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011026	AAC	2	6	25442	25447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011026	GCT	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011026	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011026	TCA	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011026	GC	3	6	27899	27904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011026	CTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011026	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011026	CG	3	6	27977	27982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011026	T	6	6	28487	28492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011026	ACT	2	6	32545	32550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011026	GAA	2	6	32628	32633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011026	A	6	6	32671	32676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011026	AAT	2	6	32738	32743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011026	T	8	8	33224	33231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011026	T	6	6	33244	33249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011026	A	7	7	34405	34411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011026	T	6	6	34445	34450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011026	ACA	2	6	35315	35320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011026	T	8	8	36636	36643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011026	CAC	2	6	36945	36950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011026	AC	3	6	36959	36964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011026	CG	3	6	36965	36970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011026	GAT	2	6	37013	37018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011026	TAG	2	6	37065	37070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011026	ATTG	2	8	38822	38829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011026	A	7	7	38832	38838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011026	T	7	7	38840	38846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011026	AAT	2	6	38848	38853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011026	TGTA	2	8	38869	38876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011026	GTT	2	6	38887	38892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011026	TGC	2	6	38982	38987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011026	AGT	2	6	39008	39013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011026	AGC	2	6	39037	39042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011026	AGC	2	6	39069	39074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011026	GTATT	2	10	39090	39099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011026	TAT	2	6	39112	39117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011026	GCA	2	6	39897	39902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011026	AAG	2	6	39936	39941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011026	A	6	6	39967	39972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011026	TTCGT	2	10	39994	40003	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011026	T	7	7	41141	41147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011026	CCG	2	6	41165	41170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011026	CA	3	6	41180	41185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011026	AC	3	6	41189	41194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011026	GC	3	6	41227	41232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011026	TTTC	2	8	41282	41289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011026	A	8	8	42323	42330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011026	A	7	7	42332	42338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011026	A	7	7	42425	42431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011026	TTC	2	6	42507	42512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011026	TGT	2	6	42524	42529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011026	TTTGT	2	10	42545	42554	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011026	CGT	2	6	44360	44365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011026	T	6	6	46048	46053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011026	CGATG	2	10	46055	46064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011026	CG	3	6	47076	47081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011026	A	7	7	47086	47092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011026	T	6	6	47149	47154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011026	CTA	2	6	47920	47925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011026	GCG	2	6	47931	47936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011026	A	7	7	47956	47962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011026	T	6	6	47977	47982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011026	GCTTT	2	10	47987	47996	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011026	CGGTT	2	10	50686	50695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011026	T	6	6	50694	50699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011026	AGA	2	6	50807	50812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011026	GAG	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011026	CGC	2	6	50840	50845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011026	CAA	2	6	50888	50893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011026	A	6	6	51870	51875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011026	T	6	6	52483	52488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011026	ATA	2	6	52547	52552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011026	AAAAC	2	10	52572	52581	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011026	T	6	6	52589	52594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011026	GAT	2	6	52600	52605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011026	A	6	6	52611	52616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011026	GCG	2	6	52631	52636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011026	TGC	2	6	52643	52648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011026	TTG	2	6	52669	52674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011026	T	8	8	52722	52729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011026	T	6	6	52761	52766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011026	TGAAAC	2	12	52807	52818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_011026	A	6	6	52824	52829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011026	AAT	2	6	54106	54111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011026	A	6	6	54118	54123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_011026	A	7	7	179498	179504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_011026	ATTT	2	8	179882	179889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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